清初，为进亠步扩大格鲁派的势力和影响，五世达赖宁公元1654年遣其弟子曲吉·昂翁彭错赴康区发展黄教，昂翁彭错于次年即达德格。在德格土司根嘎彭错的支持下在中扎柯主持修建了到康区后的第一座寺庙——格鲁派更沙寺，并担任了寺庙主持，成为更沙寺的第一代曲吉活佛。更沙寺建成后，在清代获得一些发展，先后在土司辖区建起10多座规模不大，名义上属更沙寺分寺的格鲁寺庙。

　　更沙寺无任命活佛、格西、喇嘛的教权，设曲苦活佛转世系统，职事僧侣实行3年一换制度。寺庙戒律严明，对违戒僧侣实行罚款、罚物、吊打、甚至肉刑处罚，在土司辖区享受其它教派一样的经济政治特权，·按俗民出家规定在寺庙势力范围招收僧侣。解放初统计，更沙寺共有僧侣550人，其中活佛1人，堪布2人，格西2人，喇嘛、扎巴322人。设扎巴学校1所，"曲热觉"佛学院1所，有枪100余支，可编用僧兵200余人，拥有50户科巴，500多亩耕地和1000多头牲畜，长期从事商业和高利贷经营。

　　土司统治时期，更沙寺积极参与政治活动，自觉地充当德格家族统治、麻痹人民的工具。寺庙长期建有武装力量，为扩张教派实力长期与苯苯波教登青寺摩擦争斗，曾在18世纪中叶联合甘孜太金寺僧兵，武装驱杀登青寺僧侣并破坏登青寺殿堂。解放后，寺庙上层喇嘛在西藏地方政府支持下，在民主改革期间敌视党和政府，造谣惑众并煽动僧侣以各种形式资助并参与叛乱。1959年，通过四反运动对少数参叛僧侣作出处理，废除了更沙寺的封建压迫剥削特权。

　　1983年以后，全寺僧侣在寺管会管理下开侯宗教活动，发展自养经济，逐步修复了寺庙建筑。1988年，更沙寺有僧侣145人，其中活佛1人，堪布1人，格西1人，喇嘛47人。寺庙自养经济年收人近万元。